Полимеразная цепная реакция (ПЦР) является мощнейшим инстументом современной молекулярной биологии. Анализ крови на ПЦР – лабораторный анализ, помогающий выявить наличие бактериальных и вирусных возбудителей. Чтобы это сделать, мы разрабатываем ПЦР-тест, который будет «смотреть» конкретно этот вариант из всего генома, есть он у человека или нет. Результаты ПЦР – когда готовы, расшифровка. Опытный венеролог: как быстро получить результаты анализов ПЦР. ПЦР (полимеразная цепная реакция) — это метод тестирования, который способен находить генетический материал вируса непосредственно в крови пациента, слюне или любой другой жидкости, изобретенный в 1983 году американским биохимиком Кэрри Муллисом.
12 методов в картинках: полимеразная цепная реакция
Это только часть методов ПЦР, количество которых постоянно пополняется новыми технологичными вариантами. Для проведения анализа биоматериала с помощью ПЦР необходимо обеспечить его правильное взятие. При взятии мазка из носоглотки или ротоглотки образец биоматериала собирают путем введения длинного зонда-тампона в ноздрю или в заднюю часть горла. Во время анализа крови медицинский работник возьмет образец из вены на руке с помощью небольшой иглы. Количественный ПЦР в реальном времени позволяет также оценить инфекционную нагрузку, а также определить момент, когда условно-патогенные микроорганизмы стали патогенными в результате неконтролируемого роста. Список источников Mousa G. Ghannam; Matthew Varacallo. Biochemistry, Polymerase Chain Reaction. StatPearls Publishing, 2021.
Sarah Maddocks, Rowena Jenkins. Understanding PCR. A Practical Bench-Top Guide, 1st edition, 2016.
Как так вышло? Дело в том, что помимо сильных связей с соседями по цепи, нуклеотиды умеют образовывать еще и относительно слабые водородные связи, причем А и Т всегда будут иметь две связи, а G и С - три. Таким образом, напротив А в одной цепи всегда будет стоять Т в другой, и та же фигня с G и С. Легко понять, что такие цепи, по сути, несут одну и ту же информацию. А так как двойная спираль ДНК значительно более устойчива к воздействию извне, то в ходе эволюции на заре истории Земли цепи решили подружиться и жить вместе.
Тем более, что такая дружба дала им одно очень важное преимущество. Репликация ДНК. Рано или поздно клетке надо будет поделиться, обеспечив рост организма или размножение. При этом всю эту хитро упакованную многометровую махину ДНК надо аккуратно скопипастить так, чтобы две дочерние клетки получили максимально точную копию оригинала. Вот тут-то и пригодилась двойная спираль - специальные белки в нужный момент расцепляют цепи, и на основании каждой цепи достраивается ее комплементарная копия. Отвечает за это фермент под названием полимераза. Она ползет по старой одиночной цепи ДНК и вставляет в новую цепь буквы, комплементарные старой. Видит А - вставляет Т, видит G - C, ну вы поняли.
Чтобы полимераза могла сесть на одиночную цепь ДНК и начать свое дело, ей нужна затравка - это уже готовый маленький кусочек второй цепи, сидящий на первой. Его еще называют праймер. В клетках его делает специальный фермент праймаза, да и вообще там на самом деле жесть все как сложно, но об этом в другой раз. Адская схема репликации. Все, что надо понять - была одна двойная спираль, а стали две, и помогли им в этом, помимо все прочего, праймеры и полимераза. Так или иначе, в итоге вся ДНК в клетке удваивается, и вот теперь клетка может спокойно делиться. Прочитали до сюда?
Причем результат будет сохраняться даже в течение нескольких месяцев после того, как возбудитель будет полностью побежден и удален из организма. Что значит отрицательный результат ПЦР Если ПЦР результат отрицательный, значительное число пациентов автоматически считают, что они здоровы. Это практически правильное решение. Ведь если итоги оказались отрицательными, значит фрагменты патогенного микроорганизма не были определены тест-системой. Из этого следует логичный вывод, что микроорганизма в теле нет. Однако стоит учитывать, что несмотря на всю свою высокую чувствительность и специфичность, методика имеет определенный порог чувствительности. Если концентрация возбудителя на момент обследования не переходит границу этого порога, результат будет расцениваться, как отрицательные. Хотя на самом деле окажется ложным до поры до времени. Доктора акцентируют особое внимание на том, что отрицательный результат не всегда означает отсутствие патологии. Кто из докторов выполняет расшифровку результатов ПЦР Часто среди пациентов звучит вопрос о том, какой врач будет проводить расшифровку ПЦР исследования. В первую очередь необходимо запомнить, что доверять результаты стоит тому же медицинскому работнику, что первоначально давал направление на исследование. Связана эта рекомендация с тем, что в этом случае доктор будет представлять себе, что он ожидает увидеть в анализах. Сможет грамотно интерпретировать итоги, соотнося их с клинической картиной. Получить направление наиболее часто можно от уролога, гинеколога или венеролога. Соответственно, после получения итогов относить бланк с результатами стоит кому-то из них. Важно помнить, что ПЦР — довольно дорогой метод диагностики. Его не принято использовать просто так, без специальных показаний к обследованию. Среди них: появление специфических для ЗППП симптомов обследование перед планированием беременности или процедурой искусственного оплодотворения поиск причин бесплодия и другие показания Когда показатели ПЦР становятся положительными после заражения Часто пациенты задают на приеме у медицинского работника вопрос о том, когда результаты ПЦР крови и мазков становятся положительными после заражения. Все зависит от того, насколько быстро конкретная инфекция сможет, размножаясь, пройти пороговую для теста концентрацию в материале. Преимуществом ПЦР является то, что порог чувствительности у теста довольно низкий. Это значит, что выявить признаки заражения можно даже в том случае, если количество возбудителя в биологическом материале будет минимальным. Подобная особенность дает возможность постановки диагноза даже в период инкубации, когда симптомы еще полностью отсутствуют. Однако осечка возможна и при применении ПЦР методики. Это происходит, например, если пороговая концентрация все же не успела достичь определяемых тестом значений. В этом случае велика вероятность получения далеких от правды результатов. Как отмечают доктора, ничего сложного во внешнем виде бумаги нет.
Через три недели после начала заражения две трети проверок дали отрицательный результат. Таким образом, это может быть оптимальным временем для тестирования, если цель — минимизировать ложноотрицательные результаты», — сообщили авторы исследования. Конечно, далеко не все больные точно знают, когда подхватили вирус, зато назвать момент первых признаков недомогания может почти каждый. Впрочем, сами авторы подчеркивают, что вероятность получить ложный ответ есть в любой день. Например, у некоторых людей за счет индивидуальных особенностей почему-то снижена вероятность выделения SARS-Cov-2.
Почему "ошибаются" ПЦР-тесты - эксперт
Полимеразная цепная реакция (ПЦР) — метод молекулярной биологии. ПЦР (полимеразная цепная реакция) — это метод тестирования, который способен находить генетический материал вируса непосредственно в крови пациента, слюне или любой другой жидкости, изобретенный в 1983 году американским биохимиком Кэрри Муллисом. Точное расшифровка названия ПЦР — это полимеразная цепная реакция, которая способна выявлять даже единичные бактерии и вирусы, то есть в очень малых концентрациях. Анализы при гепатите С с расшифровкой (ПЦР) являются надежным показателем наличия вируса в крови человека. Как расшифровать ПЦР Как работает ПЦР тест Ответы на эти и другие вопросы читайте в статье на нашем сайте. Полимеразная цепная реакция (ПЦР, PCR) — это точный метод лабораторной диагностики, который используют для выявления возбудителей инфекционных заболеваний.
Анализ крови ПЦР – что это такое?
- ПЦР на гепатит C: расшифровка количественного и качественного анализа, норма
- Лабораторная диагностика коронавирусной инфекции
- ПЦР на гепатит С: качественный и количественный анализ крови, расшифровка результатов
- Почему "ошибаются" ПЦР-тесты - эксперт
- Количественный анализ на гепатит С: расшифровка, маркеры
- ПЦР-тест и тест на антитела к коронавирусу: как разобраться в результатах?
Показания к исследованию
- Маркеры гепатита С и расшифровка результатов количественного анализа HCV RNA
- ПЦР-тесты: для чего нужен, как сдавать анализ, цена, можно ли верить результатам
- Что такое ПЦР-тест, и для чего его сдают
- Что такое ПЦР, и с чем её едят | Пикабу
- 12 методов в картинках: полимеразная цепная реакция
Полезные советы
- Что такое ПЦР
- ПЦР тест: что это такое? — Блог MyGenetics
- Общая информация об исследовании
- Расшифровать анализ ПЦР онлайн - Вопрос гинекологу - 03 Онлайн
- Чувствительность определения 60 МЕ/мл — что это значит?
- Частые вопросы
ПЦР анализ: что это такое? На какие 12 инфекций сдается?
Логично обнаружить IgM в разгар заболевания и сразу после регресса симптоматики. IgG вырабатываются позже, примерно с 21-28 дня от момента заражения, и сохраняются в организме более продолжительное время, в течение нескольких месяцев или лет. Следовательно, обнаружить их удастся только на стадии выздоровления или в более поздние сроки. По наличию и уровню IgG в крови можно судить, как о факте перенесенной инфекции в прошлом, так и определить наличие специфического иммунитета к данному возбудителю.
Какой способ диагностики лучше? Учитывая, чем отличается ПЦР от антител на КОВИД, разницу в данных исследованиях, нельзя однозначно определить, какой способ диагностики является предпочтительным. При наличии контакта с заболевшим человеком или инфицированным, а также в случае наличия симптомов, укладывающихся в картину коронавируса, рекомендуется ПЦР-диагностика в клинике в Перово.
Она занимает больше времени, но позволит получить достаточно достоверные данные о наличии инфекционного возбудителя в организме. Анализ окажется информативным, если заболевание проходило даже в бессимптомной форме.
Анализ на скрытые инфекции требуется после незащищенного полового акта с постоянным при наличии симптомов ЗППП или незнакомым партнером, на этапе подготовки к беременности , а также по окончанию лечения половых инфекций. Вирусы, как ВПЧ или генитальный герпес не поддаются лечению. Бактериальные и грибковые инфекции излечимы. Чтобы обнаружить скрытое присутствие вируса герпеса в крови, необходимо сдать анализ на антитела IgG. Противопоказания Соскоб ПЦР не берут во время месячных. Альтернативой может стать анализ крови. Также исследование не проводят во время местной или общей антибактериальной терапии.
Подготовка к ПЦР При взятии крови достаточно не употреблять утром пищу. Исследование проводится натощак. Анализ ПЦР урогенитального мазка предполагает соблюдение следующих рекомендаций: в течение 2-3 дней воздержаться от половой жизни, не спринцеваться, не пользоваться вагинальными препаратами и тампонами, средствами для интимной гигиены с антисептическим действием; после трансвагинального УЗИ, кольпоскопии или биопсии должно пройти не менее 2 дней; в день исследования подмыться теплой водой без применения моющих средств. Соскоб из уретры у мужчин берут не ранее, чем через 2 часа после последнего мочеиспускания.
Полное исследование проводится за 4-4,5 часа, реже — несколько дольше. Примером доклинической диагностики будет обследование в инкубационный период с момента заражения до возникновения жалоб больного , а также латентная инфекция когда симптомов нет совсем, а есть только лабораторные данные — ПЦР, к примеру. Одним из важных моментов ПЦР-диагностики является проведение ПЦР в архивном материале или биологических остатках, что важно для идентификации личности или отцовства.
В настоящее время ПЦР-диагностика подвергается существенному развитию. Происходит совершенствование самого метода, вновь и вновь появляются новые разновидности ПЦР, на медицинский рынок поступают новые тест-системы для данной реакции. Благодаря этому стоимость ПЦР-исследований с каждым годом становится доступнее для широкого круга пациентов. В ходе исследования копируется только тот участок, который подходит под заданные условия, и только в ситуации присутствия его в исследуемой пробе. Например, материал для исследования, в котором предполагается наличие фрагментов ДНК или РНК возбудителя слюна, кровь, моча, выделения из половых органов , помещается в специальный реактор амплификатор. Далее к нему добавляются специфические ферменты, которые связываются с ДНК или РНК патогена, и происходит синтез ее копии. Это копирование идет в несколько этапов по типу «цепной реакции», и в конечном итоге из одной копии генетического материала могут образоваться сотни и тысячи копий.
Затем идет анализ и сравнение результата с имеющейся базой данных о строении различных возбудителей. Посредством ПЦР можно не только выявить тип возбудителя, но и выдать количественный результат анализа, то есть как много возбудителей в организме человека. Метод ПЦР в настоящее время расширяет круг возможностей проводимых исследований: введение мутаций, сращивание фрагментов ДНК, и получил широкое распространение в медицине, к примеру, для установления отцовства, появление новых генов и прочее.
Также выполняется оценка КВМ. Читайте также: Это тоже скрининговый метод, только расширенный, более подробный.
Он фиксирует лишь факт заражения, но не определяет, стал ли конкретный вид ВПЧ провокатором заболевания. Однако вместе с цитологическим мазком, такой ПЦР-анализ повышает эффективность выявления ассоциированных с ВПЧ заболеваний половых органов. Количественный анализ ПЦР Количественный анализ диагностически более значим, чем качественный, ведь он определяет вирусную нагрузку на организм. Обычно назначается при положительных результатах качественного теста. Концентрация вируса в тканях отражает тяжесть течения инфекции, позволяет врачу составить прогноз ее течения с учетом клинических симптомов или отследить результативность проведенного лечения.
В количественном анализе подсчитывается число копий вируса, приходящихся на число клеток эпителия. Это значит, что вирус для организма неопасен и, скорее всего, иммунная система успешно подавит его. Такой результат у женщины дает основания для беспокойства. Скорее всего, врач назначит кольпоскопию с биопсией, чтобы выяснить, в каком состоянии находится эпителий шейки матки. При лечении заболеваний, ассоциированных с ВПЧ, имеет значение отслеживание вирусной нагрузки в динамике.
Если же вирусная нагрузка в контрольных анализах через 3, 6 9, 12 месяцев после лечения на порядок увеличилась — это признак рецидива инфекции. Крем и таблетки: цена, отзывы, аналоги Результаты количественного или качественного анализа обычно готовы уже на следующий день после сдачи. Он позволяет выявить конкретные штаммы, присутствующие в клинически значимой концентрации. Этот анализ и самый дорогой. Его цена примерно в два раза выше, чем у качественного анализа на такое же количество штаммов в среднем 2200 против 1200 не считая стоимости забора материала.
Дайджин-тест более простой в выполнении, чем ПЦР-анализ, и вместе с этим отличается высочайшей надежностью. Поэтому многие развитые страны включают в скрининговое исследование именно его. Тест может быть комплексным — для группы низкого и повышенного риска, или проводиться отдельно для каждой группы. Оценивается только присутствие вирусов в клинически значимой концентрации, то есть одновременно оценивается и вирусная нагрузка. В группе высокоонкогенных вирусов проверяется наличие 13 типов: 16, 18, 31, 33, 39, 35, 45, 51, 52, 56, 59, 58, 68 штаммов.
В группе вирусов с низким риском — 6, 11, 42, 44, 43. Полученные результаты не дифференцируются по штаммам. Ошибки при нахождении штамма практически исключены. Концентрация обозначается в других единицах, нежели в анализе ПЦР — не в геном-эквивалентах, а в относительных единицах они отражают отношение количества копий вируса к значению, которое считается пороговым. Положительным считается результат, превышающий 1 относительную единицу.
В отличие от ПЦР-анализа, ответы Digene-теста клиники готовят в течение 10 дней. Если получен результат ниже количественно значимого порога, будет выдан ответ «не обнаружено». Поэтому результаты дайджен-теста и качественного ПЦР-анализа, в котором даже минимальное количество вируса считается положительным результатом, могут быть противоположными. Врачи рекомендуют проходить digene-тест, поскольку при прочих равных он выгоднее в финансовом плане — после получения результатов не придется отдельно проводить количественный анализ. Подготовка к анализам Как уже говорилось, и в ПЦР-анализе, и в дайджин-тесте используется генетический материал.
Для его получения необходимо выполнить забор клеток эпителия из урогенитального тракта. Обычно у женщин берут соскоб из цервикального канала, у мужчин — из уретры. Иногда используется материал из прямой кишки, полости рта — при наличии там новообразований.
О рекомендациях, как подготовиться к сдаче ПЦР-теста на COVID-19
Отличие иммуноферментного анализа (ИФА) от полимеразной цепной реакции (ПЦР) в том, что ПЦР относится к прямым методам выявления возбудителя инфекции, то есть позволяет определить РНК вируса SARS-CoV-2 в биоматериале человека. Однако, тест на определение антител класса М может давать неспецифическую реакцию, что в ряде случаев приводит к ложноположительному результату. Анализы при гепатите С с расшифровкой (ПЦР) являются надежным показателем наличия вируса в крови человека. Что такое ПЦР, как работает метод ПЦР в диагностике, преимущества методики, показания, подготовка к проведению ПЦР-анализа, как проводится ПЦР-анализ, что показывают результата теста. Если ПЦР, экспресс-тест и IgM-антитела отрицательные, это скорее всего значит, что в последние 2-3 недели коронавируса у вас не было.
Результаты ПЦР диагностики
ПЦР-тест или полимеразная цепная реакция – метод молекулярно-генетического исследования, указывающий на наличие или отсутствие инфекции в организме больного. Чтобы диагностировать присутствие вируса в организме, сначала появились тесты ПЦР – полимеразной цепной реакции. Расшифровка ПЦР на гепатит С должна проводиться квалифицированным специалистом. Дайджин-тест более простой в выполнении, чем ПЦР-анализ, и вместе с этим отличается высочайшей надежностью. Результаты ПЦР – когда готовы, расшифровка. Опытный венеролог: как быстро получить результаты анализов ПЦР. эксперт Читайте онлайн публикации на актуальные темы на интернет-портале